Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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