Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GypcQ78HU7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GypcQ78HU7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GypcQ78HU7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GypcQ78HU7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms