Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms