Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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