Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gpbp1l1Q6NZP2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms