Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms