Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMF0

Krt87, Keratin, type II cuticular 87, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt87Q6IMF0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt87Q6IMF0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Krt87Q6IMF0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Krt87Q6IMF0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Krt87Q6IMF0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt87Q6IMF0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt87Q6IMF0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms