Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms