Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cep290Q6A078 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cep290Q6A078 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cep290Q6A078 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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