Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr2kQ63871 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms