Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Lcn4Q62472 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Lcn4Q62472 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Lcn4Q62472 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Lcn4Q62472 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Lcn4Q62472 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Lcn4Q62472 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Lcn4Q62472 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Lcn4Q62472 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Lcn4Q62472 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Lcn4Q62472 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Lcn4Q62472 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Lcn4Q62472 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms