Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
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Hoxa13Q62424 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Hoxa13Q62424 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Hoxa13Q62424 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Hoxa13Q62424 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Hoxa13Q62424 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms