Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms