Protein–RNA interactions for Protein: Q62170

Selplg, P-selectin glycoprotein ligand 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelplgQ62170 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SelplgQ62170 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms