Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms