Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Npm1Q61937 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms