Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms