Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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AtrxQ61687 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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AtrxQ61687 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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AtrxQ61687 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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AtrxQ61687 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms