Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms