Protein–RNA interactions for Protein: Q61233

Lcp1, Plastin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcp1Q61233 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcp1Q61233 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms