Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CttnQ60598 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CttnQ60598 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CttnQ60598 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CttnQ60598 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms