Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms