Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

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Length 1,440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Tns3Q5SSZ5 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tns3Q5SSZ5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tns3Q5SSZ5 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Tns3Q5SSZ5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tns3Q5SSZ5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Tns3Q5SSZ5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Tns3Q5SSZ5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Tns3Q5SSZ5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tns3Q5SSZ5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tns3Q5SSZ5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
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Tns3Q5SSZ5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tns3Q5SSZ5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
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Tns3Q5SSZ5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tns3Q5SSZ5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Tns3Q5SSZ5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tns3Q5SSZ5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Tns3Q5SSZ5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Tns3Q5SSZ5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tns3Q5SSZ5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tns3Q5SSZ5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tns3Q5SSZ5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tns3Q5SSZ5 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Tns3Q5SSZ5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tns3Q5SSZ5 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tns3Q5SSZ5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Tns3Q5SSZ5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tns3Q5SSZ5 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Tns3Q5SSZ5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tns3Q5SSZ5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tns3Q5SSZ5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tns3Q5SSZ5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tns3Q5SSZ5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tns3Q5SSZ5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tns3Q5SSZ5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms