Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms