Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc88aQ5SNZ0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms