Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf3Q5HZG4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms