Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc3Q5DU56 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Nlrc3Q5DU56 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms