Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1nQ497L1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms