Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pacs2Q3V3Q7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pacs2Q3V3Q7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pacs2Q3V3Q7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pacs2Q3V3Q7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pacs2Q3V3Q7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pacs2Q3V3Q7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pacs2Q3V3Q7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pacs2Q3V3Q7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pacs2Q3V3Q7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pacs2Q3V3Q7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pacs2Q3V3Q7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pacs2Q3V3Q7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pacs2Q3V3Q7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pacs2Q3V3Q7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pacs2Q3V3Q7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pacs2Q3V3Q7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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