Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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BC051142Q3V0M8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BC051142Q3V0M8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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