Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
4930596D02RikQ3V0H9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930596D02RikQ3V0H9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
4930596D02RikQ3V0H9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930596D02RikQ3V0H9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930596D02RikQ3V0H9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
4930596D02RikQ3V0H9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930596D02RikQ3V0H9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930596D02RikQ3V0H9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930596D02RikQ3V0H9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930596D02RikQ3V0H9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930596D02RikQ3V0H9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930596D02RikQ3V0H9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930596D02RikQ3V0H9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930596D02RikQ3V0H9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930596D02RikQ3V0H9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930596D02RikQ3V0H9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930596D02RikQ3V0H9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930596D02RikQ3V0H9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930596D02RikQ3V0H9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
4930596D02RikQ3V0H9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930596D02RikQ3V0H9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930596D02RikQ3V0H9 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930596D02RikQ3V0H9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
4930596D02RikQ3V0H9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms