Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm44Q3V089 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms