Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Gm38123-201ENSMUST00000194990 2779 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 AC123619.1-203ENSMUST00000225276 2757 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 A630012P03Rik-202ENSMUST00000114854 1974 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Gm39244-201ENSMUST00000209663 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms