Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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