Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms