Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc34Q3UI66 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms