Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mier3Q3UHF3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mier3Q3UHF3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mier3Q3UHF3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms