Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Kdm4dQ3U2K5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Kdm4dQ3U2K5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Kdm4dQ3U2K5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Kdm4dQ3U2K5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Kdm4dQ3U2K5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Kdm4dQ3U2K5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Kdm4dQ3U2K5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Kdm4dQ3U2K5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Kdm4dQ3U2K5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Kdm4dQ3U2K5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Kdm4dQ3U2K5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Kdm4dQ3U2K5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Kdm4dQ3U2K5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Kdm4dQ3U2K5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Kdm4dQ3U2K5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Kdm4dQ3U2K5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Kdm4dQ3U2K5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Kdm4dQ3U2K5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Kdm4dQ3U2K5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Kdm4dQ3U2K5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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