Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Lrrn4clQ3TYX2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Lrrn4clQ3TYX2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Lrrn4clQ3TYX2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Lrrn4clQ3TYX2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms