Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWN3

Cnnm2, Metal transporter CNNM2, mousemouse

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Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm2Q3TWN3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm2Q3TWN3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms