Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms