Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms