Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms