Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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