Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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