Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms