Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms