Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Rpusd3Q14AI6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rpusd3Q14AI6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rpusd3Q14AI6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rpusd3Q14AI6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rpusd3Q14AI6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rpusd3Q14AI6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rpusd3Q14AI6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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