Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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