Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VgfQ0VGU4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
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VgfQ0VGU4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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VgfQ0VGU4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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VgfQ0VGU4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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VgfQ0VGU4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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VgfQ0VGU4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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VgfQ0VGU4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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VgfQ0VGU4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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VgfQ0VGU4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms